作为一所“麻雀学校”，广东药学院现在是翻天覆地，虽然在大学城里它呈一个狭长的形状，但设计很巧妙，使用连廊等手法把各个建筑连成一体，校园内依山傍水，山水相融。特别是在建设中保留了历史遗迹——基地内大石冈炮台遗址，形成疏朗、明快、稳重、活泼的现代建筑风格与珍贵的历史人文景观融为一体的独特校园风景。

　　图书馆是全院的至高点，也是学校标志性建筑，其横贯中央、从山上延伸至湖面的学海长廊以及与教学大楼连通的空中飞廊，非常有创新灵感。教学楼长达460米，可同时容纳12000人上课。

　　根据广东药学院的规划，到2010年，大学城主校区将安排1万本科生，5000本科生在赤岗校区，宝岗校区将作为成人继续教育、研究机构基地。大学城校区将全面实行学分制，实行教师主讲制度和学生主选修制度。学生在大学城校区或赤岗校区学习，根据校区的专业设置而定，不受收费标准不同的影响；学生按录取批次不同分批编班，但统一教学管理、统一学籍管理，按规定统一发放毕业证书和学位证书。